中医治疗失眠的缺点是相对于西医来说的，在疾病的治疗上，中医相比于西医往往见效慢一些，这对追求速度的现代人来说，西医成了他们的首选。中药尤其是汤药服用很不方便，所以西药仍是很多人尤其是青年人的选择。但西医的缺点在近年来也逐渐暴露了出来，中医又受到了越来越多的重视。

中医医师缺乏神经学相关的微观生理学和病理学基础，所以在治疗一些顽固性失眠时候会显得比较无助。因为中医的用药毕竟是比较缓的。