大多数肾结石疾病患者都会出现腰疼和腹部疼痛的症状，肾结石患者体内较大的结石，在肾盂或肾盏内压迫、摩擦或引起积水，多为患侧腰部钝痛或隐痛，常在活动后加重;肾结石患者体内较小的结石，在肾盂或输尿管内移动和刺激，引起平滑肌痉挛而出现绞痛，这种绞痛常突然发生，肾结石患者疼痛剧烈，如刀割样，沿患侧输尿管向下腹部、外阴部和大腿内侧放射。

肾结石疾病患者的早期症状会出现尿频、尿急的现象，个别由于肾结石长期刺激，导致肾内上皮化生，芦至发生磷状上皮癌，这时将呈持续性严重血尿。急性肾绞痛常伴明显肉眼或镜下血尿。结石停止移动数天后，血尿消失。少数结石引起完全性阻塞时可无血尿。结石若合并感染，则血尿和脓尿同时发生。