指甲有横纹并且凹凸不平可能由外伤、营养缺乏、甲真菌感染或全身性疾病等原因引起，具体原因需结合横纹形态和伴随症状综合判断。

1、外伤或挤压：指甲根部受到磕碰、挤压或不良美甲习惯可导致甲母质暂时受损，形成横纹凹凸不平，通常随指甲生长逐渐推移消失，无须特殊治疗，注意保护指甲即可。

2、营养缺乏：长期偏食或消化吸收障碍导致蛋白质、铁、锌、维生素A或B族维生素不足时，指甲生长受阻出现横纹凹陷，建议均衡膳食，适量补充瘦肉、蛋类、深绿色蔬菜和坚果。

3、甲真菌感染：真菌侵犯甲板后引起甲面增厚、变色、横纹及凹凸不平，常伴有甲下碎屑或甲分离，需在皮肤科医生指导下使用抗真菌药物如特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等进行治疗。

4、全身性疾病：严重发热、肺炎、心肌梗死或化疗等重大应激事件后，甲母质暂时停止生长形成博氏线，表现为横沟状凹凸，原发病控制后指甲可逐渐恢复，若持续存在需排查慢性肝肾疾病或甲状腺功能异常。

建议日常保持指甲清洁干燥，避免过度打磨甲面，若横纹持续不消退或伴随甲周红肿、甲板变脆脱落，应及时到皮肤科就诊明确诊断。