肛瘘和痔疮是完全两种性质的疾病。痔疮是血管性的疾病。主要以静脉曲张为主。而肛瘘是一种感染性的疾病，主要是大肠杆菌引起的软组织的感染，痔疮的症状主要是便血，疼痛，质地偏软。肛瘘主要症状是流脓，疼痛，质地偏硬。
