不过由于每一位患者身体体质不同，对于抗生素的敏感性也不一样，因此治疗非淋菌尿道炎必须要去医院检查后才好安排药物方案。
需要去医院泌尿外科做细菌培养和药物敏感度检查，根据结果来判断具体对哪一种抗生素较为敏感，然后口服敏感度高的抗生素治疗即可。
在没有确定药物敏感性之前不可胡乱用药，如果口服耐药的抗生素就是没有治疗作用的，反而会错过最佳治疗时间。临床上比较常用的有四环素类抗生素、大环内酯类抗生素、喹诺酮类抗生素等等。另外由于此病会通过性生活传染，因此需要性伴侣对象一起检查治疗，以防后续交叉传染而复发。
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