第一，体格检查。医生会询问患者性接触史，过敏史，同时需要肉眼观察看龟头具体病情表现是否存在红肿，溃疡，渗出等等。
第二，分泌物检查。需要通过包皮类拭子来进一步检查是否有存在念珠菌，滴虫，细菌等病原体，必要时还需要做细菌培养。
第三，尿常规。需要通过尿常规判断尿液中是否有细菌，尿糖是否正常，是否同时存在尿路感染等等。
第四，病毒筛查。如果龟头炎表现为溃疡水泡，需要做聚合酶链反应检测判断是否有疱疹。第四，梅毒血清学检查。对于有存在明显溃疡的龟头炎患者，也需要进一步抽血检查梅毒螺旋抗体来排除梅毒的可能性。
第五，组织病理检查。对于龟头炎持续存在不能明确诊断的患者，还需要进一步做组织病理检查，以排除恶性疾病的可能性。
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