第一就是上腹痛，上腹痛多无规律性，部分患者上腹痛与进食有关，表现为胀痛，进食后缓解或表现为餐后零点五到三小时之间腹痛持续存在。
第二就是腹胀、早饱、嗳气，部分患者会感到腹胀，尤其是餐后有明显的饱胀感，过程持续性，进餐后加重。早饱是指有明显饥饿感但进食后不久就有饱感，进食量明显减少等等。
第三就是便秘和腹泻。顽固性消化不良是导致便秘的原因之一，因为食物长时间滞留在胃肠部就会形成毒素、宿便，从而造成胃肠道功能的失调，而且消化不良也容易造成胃肠菌群的失调从而造成腹泻症状的出现。
第四就是其他症状，不少患者同时伴有失眠、焦虑、抑郁、疼痛、注意力不集中等精神症状，这些症状多与恐癌心理有很大的关系。
