甲状腺功能五项在某些医疗机构中是促甲状腺激素，游离甲状腺素，游离三碘甲状腺原氨酸这三个项目，另外增加甲状腺过氧化物酶抗体，甲状腺球蛋白抗体，甲状腺球蛋白，促甲状腺激素受体抗体这四项中的两项。但也有医疗机构把促甲状腺激素，游离甲状腺素，游离三碘甲状腺原氨酸，甲状腺素，三碘甲状腺原氨酸这5项组合作为甲功五项。
所以不同的医疗机构里面，甲功五项所代表的意义和用来判断的疾病情况也是不一致的。但至少都可以判断甲状腺功能是否异常；异常的甲状腺功能是原发性甲状腺功能异常还是继发性甲状腺功能异常；也可以判断甲状腺功能异常是甲状腺功能亢进，还是甲状腺功能减退。如果是包含抗体的检查，还可以在一定程度上评估甲状腺功能异常的病因。
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