病毒性角膜炎可反复发作并引起相应并发症，如角膜溃疡、严重时角膜穿孔，有可能需要全身应用抗病毒药物或对症治疗。
真菌性和免疫性角膜炎若治疗及时，费用不高，若延误治疗，可合并细菌、病毒感染，病变侵犯角膜较深层组织，致角膜溃疡甚至穿孔，可能需要行羊膜移植或角膜移植，费用较高。并且根据医院所处的地域不同，医院级别不同，收费标准也不一样，大概费用几千至几万不等。
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