葡萄膜炎的详细病因不明确，发病机制复杂，葡萄膜血管和色素丰富，具有较多免疫活性物质，该病多与自身免疫反应有关，还与自由基氧化还原反应及前列腺素等炎症介质增高有关。可分为感染性和非感染性葡萄膜炎。
感染性葡萄膜炎主要包括致病微生物直接进入眼内，多见于眼外伤、眼部手术后等引起的葡萄膜炎，若未能及时发现及治疗，可发展成眼内炎，治疗效果较差。非感染性葡萄膜炎多与免疫异常有关，部分病人可伴有全身性免疫性疾病，多合并强直性脊柱炎、类风湿关节炎等风湿免疫性类疾病。
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