第一就是去除诱因，比如病人此次病情加重的原因是没有规律服用药物或者是伴随感染等，那么要去除诱因；如果有感染，首先要控制感染。
第二就是对症治疗，针对肠道的炎症本身，不同溃疡性结肠炎的类型治疗方法不同，比如患者的炎症主要是累积直肠和乙状结肠，可能有时候程度比较轻，进行灌肠的治疗就可以了。但是如果炎症累及的肠段范围比较广泛或者是程度比较重，就要考虑其他治疗，比如长期使用非甾体类的抗炎药，甚至部分患者需要使用激素，使用的方式可能不一样。轻症患者倾向于口服，重症患者倾向于静脉滴注。有些病人炎症程度比较重，还要考虑使用免疫抑制剂或者是英夫利西单抗之类的药物。
第三就是支持治疗，溃疡性结肠炎患者需要进行营养方面的支持治疗，以维持内环境的稳定。因为患者存在腹痛、腹泻、粘液浓血便等症状，营养状况不佳，需要加强患者营养方面的支持，包括给予肠道益生菌等等，以维持肠道稳定的微生态环境。
