首先选择的就是抗病毒类药物，比如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦，都是常用，而且效果比较不错的药物。对于初次发作的患者，一般需要应用7-10天左右，就可以收到一个比较不错的效果。
对于复发患者，一般应用5天左右就可以。但是临床有一些患者属于反复发作，这样的患者需要连续口服药物半年左右，而且患者还可以应用阿昔洛韦软膏、喷昔洛韦软膏，在局部进行外涂。
如果患者皮肤同时合并有细菌感染的情况发生，还可以用抗生素类的软膏来涂抹，比如红霉素软膏、百多邦软膏都是可以的。生殖器疱疹患者要解除心理负担，平时注意劳逸结合，安排好工作、生活与运动时间，增强体质，规范应用抗病毒药物治疗，尽可能控制住病情，减少复发。
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