基孔肯雅热的并发症主要包括关节疼痛持续不退、心肌炎、神经系统损害和眼部病变，可通过对症治疗、抗炎药物、重症监护和专科干预等方式处理。

1、关节疼痛

关节疼痛可能与病毒侵袭滑膜组织及免疫反应激活有关，通常表现为对称性小关节肿胀。可遵医嘱使用洛索洛芬钠片、塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等非甾体抗炎药。

2、心肌炎

心肌炎可能与病毒直接损伤心肌细胞或免疫介导性损伤有关，常伴随心悸和胸闷。需严格卧床休息，必要时使用甲泼尼龙琥珀酸钠、磷酸肌酸钠等药物。

3、神经损害

神经系统并发症可能与血脑屏障破坏相关，可出现脑膜脑炎或格林巴利综合征。需神经科会诊，考虑静脉注射免疫球蛋白或糖皮质激素治疗。

4、眼部病变

眼部病变可能与病毒性葡萄膜炎或视网膜炎有关，表现为视力模糊。需眼科专科治疗，局部应用糖皮质激素滴眼液或散瞳药物。

急性期应保证充分休息，恢复期可进行低强度关节活动，饮食需补充优质蛋白和维生素C以促进组织修复。