根据发生甲减的病因不同，甲减是否可以根治或临床治愈也是不相同的。如果甲状腺功能减退是由于某些炎症，手术或外伤所引起的破坏，比如亚急性甲状腺炎，急性化脓性甲状腺炎等，大多数患者在这些情况过后，随着原发病的病情逐渐好转，甲状腺功能减退会逐渐恢复正常。
但如果是由于自身免疫性因素所引起的甲状腺功能减退，如桥本甲状腺炎引起的甲状腺功能减退，或幼年时期发生的不明原因甲减，大多需要进行长期的正规的治疗，并且定期的进行甲状腺激素水平的检查，保持在正常水平，此时就不能达到临床治愈，但是可以长期稳定在正常水平，控制比较好，对身体健康影响也并不大。总之，甲状腺功能减退症，部分患者可以根治，另一部分患者虽然不能完全治愈，但经过正规的治疗，也能够达到比较好的效果。
