第一方面影像学的检查，B超检查可以诊断卵巢异位囊肿和膀胱直肠内膜异位症，可以确定异位囊肿的位置大小和形状，囊肿呈圆形或椭圆形与周围，特别是子宫粘连，囊内有细小的絮状光点，另外就是腹腔镜的检查，是目前国际公认的内膜异位症诊断的最佳方法，可以在直视下检查病变，并且可以对病灶或者是可疑病变的部位进行活组织检查，可以确诊。还可以做血清CA125的测定，血清CA125的水平可能增高，重症的患者会更为明显。
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