首先第一方面就是特异性肠炎，特异性肠炎通常是饮食不洁、细菌、病毒等感染引起的，如果初次治疗不彻底，出现耐药性，引起便溏、腹泻、腹痛的慢性症状的出现，可以采取局部的细菌培养以及大便常规的检查。如果发现特异性肠炎的病变，给予针对性的治疗，疗效非常显着，比如说如果是细菌感染，要适当的应用抗生素，比如说喹诺酮类的、头孢类的；如果是病毒感染的，要及时应用抗病毒药物的治疗。还有就是止泻药物和保护肠黏膜的药物，止泻药物通常用的是思密达和易蒙停。
而非特异性慢性肠炎，它包括克罗恩病和溃疡性结肠炎，在治疗上要发挥中药的特性，辨证体质做针对性的治疗，效果非常好，比如说采用肠炎清、肠康丸、心舒等，辩证治疗慢性溃疡性结肠炎疗效非常显著。
