CT和磁共振的主要区别在于成像原理、适用疾病和检查特点，CT适合快速检查骨骼和急性出血，磁共振更适合软组织病变和神经系统疾病。

CT利用X射线穿透人体组织后不同密度的衰减差异成像，扫描速度快，对骨骼、肺部、急性脑出血等结构显示清晰，检查时间通常5-10分钟完成，但存在电离辐射。磁共振通过氢原子核在磁场中的共振信号成像，无辐射，对脑组织、脊髓、关节软骨等软组织分辨率高，可多角度三维重建，但检查需15-60分钟，体内有金属植入物者受限。两者在急诊创伤中CT更常用，磁共振对早期肿瘤、癫痫灶定位更具优势。

CT设备呈环形封闭结构，检查时需保持静止，造影剂可能引起碘过敏反应，价格相对较低。磁共振检查舱较深且噪音明显，幽闭恐惧症患者可能不适，钆造影剂存在肾源性纤维化风险，费用通常是CT的2-3倍。孕妇早期慎用，磁共振需去除所有金属物品，心脏起搏器患者禁止检查。

检查前需根据病情需要选择，突发头痛呕吐首选CT排除脑出血，关节韧带损伤建议磁共振。检查后应多饮水促进造影剂排泄，磁共振检查后无特殊禁忌，增强扫描后需观察30分钟。两种检查互补而非替代，临床常需结合应用。