乳糖酶的分泌量减少或者不高。就不能完全消化和分解乳汁中的乳糖。乳糖不耐受主要原因就是分解乳糖的乳糖酶缺乏或者分泌不足，这可以分为原发性或者继发性。
原发性是指由于遗传因素引起的，这种需要外源性的补充乳糖酶帮助机体去消化所摄入的乳糖。还有一种是继发性的引起乳糖酶数量减少或者活性降低，秋季多发性腹泻，细菌性腹泻引起的肠胃功能暂时低下，乳糖酶分泌减少或活性降低，而且持续饮奶会引起继发性乳糖不耐受。当宝宝出现乳糖不耐受时，主要是由于乳糖酶分泌不足引起的，最常见的临床表现就是胃肠道反应，表现为：腹痛、腹泻等。
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