同房后第三天小腹隐痛可能与生理性因素或妇科疾病有关，常见原因包括排卵期疼痛、盆腔充血、盆腔炎、子宫内膜异位症、尿路感染等。建议观察伴随症状，必要时就医检查。

1、排卵期疼痛

若处于月经周期中期，可能因排卵引起短暂隐痛。卵泡破裂时少量出血刺激腹膜可导致单侧下腹坠胀，通常持续1-2天自行缓解。可热敷腹部缓解不适，避免剧烈运动。若疼痛持续超过48小时或伴随异常出血需排除黄体破裂。

2、盆腔充血

性兴奋导致的盆腔血管扩张可能延迟消退，尤其性行为较剧烈时更易发生。表现为弥漫性隐痛，无固定压痛点，休息后多能改善。建议避免频繁同房，采用侧卧屈膝体位促进血液循环。

3、盆腔炎

细菌上行感染引发的盆腔炎症可出现持续性隐痛，常伴异常分泌物增多、发热等症状。可能与淋病奈瑟菌、衣原体感染有关。需遵医嘱使用注射用头孢曲松钠联合盐酸多西环素片，或左氧氟沙星氯化钠注射液治疗。

4、子宫内膜异位症

异位内膜组织在性刺激后充血肿胀，可能导致深部性交痛及事后隐痛。典型症状包括进行性痛经、不孕等。确诊需腹腔镜检查，治疗可选用地诺孕素片或注射用醋酸亮丙瑞林微球。

5、尿路感染

性行为可能将尿道口细菌带入膀胱，引发膀胱炎表现为下腹隐痛伴尿频尿急。常见病原体为大肠埃希菌。可查尿常规确认，遵医嘱服用磷霉素氨丁三醇散或盐酸左氧氟沙星胶囊，治疗期间多饮水。

建议记录疼痛持续时间、强度变化及伴随症状，避免自行服用止痛药掩盖病情。保持外阴清洁干燥，选择棉质内裤并及时更换。出现发热、异常阴道流血、排尿灼痛或疼痛持续加重时，应立即至妇科或泌尿外科就诊，完善妇科检查、超声及实验室检测以明确病因。日常注意同房卫生，事后及时排尿有助于预防尿路感染。